我國科學家實現對斑馬魚全腦十萬級神經元實時監控

3 月 25 日消息,據中國科學院自動化研究所消息,該所蒿傑研究組與中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心杜久林研究組、穆宇研究組合作研究開發了一套實感智能計算-控制平台,可快速提取和分析斑馬魚全腦神經元活動,實現神經元集群活動的閉環調控

相關研究論文以 Real-time analysis of large-scale neuronal imaging enables closed-loop investigation of neural dynamics 為題,在線發表於《自然・神經科學》(Nature Neuroscience)。

據介紹,該研究藉助天文學領域的數據處理技術,採用 FPGA-GPU 混合架構,成功對高達 500MB/s的大數據流神經功能數據進行實時配准、信號提取和分析。通過這一技術突破,研究團隊首次實現了對斑馬魚全腦十萬級神經元的實時監控,進而對任意選擇的神經元集群活動進行解碼,以控制外部設備。

這一成果標誌著基於全腦單細胞光學成像的虛擬現實、光遺傳調控等技術在腦科學閉環研究領域的應用邁出了關鍵一步。

全腦範圍單神經元活動成像是解析大腦並行分散式計算原理的有力工具,但其巨大的數據實時處理需求成為了技術發展的瓶頸,導致難以實時分析以及在大尺度上閉環調控和研究腦功能。

啟發於天文學領域中快速射電暴檢測技術,研究人員借鑒其系統設計策略,利用 FPGA 編程的靈活性建立光學神經信號預處理系統,對來自光學感測器的信號規整化,並將其發送給基於 GPU 的實時處理系統,進行高速非線性配准,提取各信道的神經信號,依據編碼規則進行解碼,以獲得用於控制外部器件的反饋信號。該系統通過實時監測斑馬魚全腦神經元的活動,生成反饋信號,反饋間隔小於 70.5 毫秒

系統性能在三個腦科學閉環研究場景下得到展示:與任意特定神經元集群活動鎖相的實時光遺傳學刺激,與特定大腦功能狀態鎖相的實時視覺刺激,以及基於神經元集群活動的虛擬現實控制

  • 閉環實時光遺傳學神經調控:通過功能聚類識別全腦神經元集群,將選定集群的自發活動作為觸發信號,實施實時光遺傳學刺激於目標神經元集群。相對於開環,閉環刺激有效激活了下游腦區。
  • 鎖相的實時視覺刺激實驗:通過對藍斑去甲腎上腺素能系統活動的實時監測,在表徵動物清醒狀態的藍斑興奮時相上施加視覺刺激,觀察到大腦中其他神經元的反應更為強烈。這表明,大腦狀態可調節對視覺信息的處理,同時指出閉環感覺刺激有助於精確研究大腦內部狀態與外界環境的相互作用。
  • 全腦光學腦機介面實現的虛擬現實:實時將高維的全腦所有神經元活動降維到多個神經元集群的活動,並將任一集群的活動與視覺環境閉環聯接,建立了基於光學成像、直接從腦神經活動到視覺環境的虛擬現實系統。在該虛擬現實中,可以隨意調整神經活動與環境耦合的增益,使控制環境的神經元集群根據增益變化適應性地調整其輸出。依託大數據流的實時分析和高通量全腦成像技術,未來研究將篩選適合光學腦機介面的神經群體活動特徵,揭示其機制,並開發出更高效的光學腦機介面技術。

中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心杜久林研究員、中國科學院自動化研究所蒿傑研究員、中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心穆宇研究員為共同通訊作者;暨南大學 / 深圳市神經科學研究院尚春峰研究員(原中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心副研究員)、中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心汪玙璠博士、中國科學院自動化研究所趙美婷助理研究員為共同第一作者;中國科學院自動化研究所范秋香助理研究員,中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心趙姍博士生、錢禹工程師和徐聖進研究員做出了重要貢獻。

該工作得到科技部、基金委、中國科學院、上海市和深圳市的資助。研究成果已授權發明專利「光學腦機介面系統和方法」(專利號:ZL20231 0131178.9)。

轉自:https://www.ithome.com/0/757/828.htm

論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41593-024-01595-6

作者: 張津東

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